Функционал создания новой Аптеки находится в подсистеме РДС (RDS).

Для создания новой аптеки нужно выбрать пункт меню Справочники-Справочник аптек и нажать кнопку +

либо открыть сущность Аптека (PHARMACY) через меню команд - Просмотр произвольно списка.

В открывшей форме заполняем обязательные поля и сохраняем форму.

Далее переходим в APS, нам необходимо подгрузить данные из РДС воспользовавшись хранимой процедурой.

Кликнув правой кнопкой мыши на нужной строке выбираем пункт Загрузить из выпавшего меню 

Далее переходим в меню Справочники-Организации-Аптеки, в списке аптек должна появиться добавленная нами аптека.

Открыв карточку аптеки, дополним ее необходимыми данными для работы с федеральными сервисами.

После создания аптека ее нужно добавить в РДС в  сущность Сервера синхронизации (SYNC_SERVERS) новую аптеку