Для формирования СЭМД "Протокол патолого-анатомического вскрытия" в главном окне программы необходимо перейти последовательно в дереве папок СЭМД - документы/ОНКО/Протокол патолого-анатомического вскрытия.
Далее следует перейти в папку "Протокол патолого-анатомического вскрытия" дважды кликнув левой кнопкой мыши по папке. В открывшемся списке с помощью правой кнопки мыши создать новый документ, открыв контекстное меню и выбрав пункт "+ Новый".
Откроется форма поиска амбулаторной карты. В поле "Поиск" следует ввести данные для поиска пациента в программе. После того, как пациент будет найден, следует нажать кнопку 
для создания документа СЭМД "Протокол патолого-анатомического вскрытия".
Откроется форма "Протокол патолого-анатомического вскрытия в формате CDA". В открывшейся форме, в левой части отобразятся наименование секций и поля, расположенные в них, которые необходимо заполнить для дальнейшего формирования документа.
Для заполнения необходимых данных в секциях, указанных в левой части формы, следует нажать кнопку "Добавить", либо "Открыть" (если информация частично уже заполнена в секции), расположенную напротив заголовка секции в правой части и перейти на соответствующую форму для заполнения данных.
В секции "Сведения о документе" следует внести номер протокола. После заполнения данных, сохранить форму, нажав кнопку Ок.
В секции "Информация об умершем" необходимо заполнить данные медицинской организации, подразделении и отделении, в котором наблюдался и умер пациент; указать семейное положение, образование и занятость умершего.
После заполнения данных, сохранить форму, нажав кнопку Ок.
В секции "Патолого-анатомический диагноз (предварительный)" необходимо заполнить данные о диагнозах: основном, сопутствующем и осложнении.
После заполнения данных, сохранить форму, нажав кнопку Ок.
В секции "Диагноз" необходимо заполнить данные о диагнозах: основном, сопутствующем и осложнении.
После заполнения данных, сохранить форму, нажав кнопку Ок.
В секции "Заключение по результатам патолого-анатомического вскрытия" необходимо заполнить информацию о дефектах оказания медицинской помощи, причине смерти, заполнить клинико-патолого-анатомический эпикриз.
На форме "Заключение пот результатам патолого-анатомического вскрытия", в подсекции "Патолого-анатомический диагноз" необходимо заполнить данные о диагнозах: основном, сопутствующем и осложнении. После заполнения данных, сохранить форму, нажав кнопку Ок.
После того, как все необходимые сведения заполнены, в левой части формы ""Протокол патолого-анатомического вскрытия в формате CDA" отобразится сформированный документ.
Далее следует нажать кнопку "Ок", расположенную в нижней части формы, подписать сформированный документ,
после чего он автоматически будет отправлен в РЭМД.
После того как СЭМД будет сформирован и сохранен, запись о созданном документе отобразится на форме поиска амбулаторной карты, в таблице.
На форме поиска амбулаторной карты также следует нажать кнопку Ок для сохранения сформированного документа. В списке отобразится сформированнные СЭМД.
